【ストーリー】
ガルズオルムとの最終決戦――プロジェクト・リザレクション――を完遂したセレブラントたちは、世界各地の残存部隊との戦いを続けていた。
　セレブラントとして舞浜サーバーを守った「ソゴル・キョウ」は、雪が降りしきる冬の舞浜で目を覚ます。　
　「ずっと夏にいた気がする……」
　記憶の欠損に困惑するキョウだったが、そこに新たな脅威・オルタモーダが出現する。
　自らをヒカリタツモノと名乗る「ハル・ヴェルト」はサブスタンスシェイドと呼ばれる未知の能力で襲ってくる。
　AI「ルーパ」の助けにより、これまでの記憶をダウンロードしたキョウは光対装備で対抗することになるが、これは互いの世界と存在をかけた戦いのほんの序章に過ぎなかった……。

【封入特典】
■特典ディスク1
　・『ゼーガペイン Memories in the shell』 　・「パチスロ　ゼーガペイン2」スペシャル映像
　・『ゼーガペインSTA』ミュージッククリップ
　・『ゼーガペインSTA』 ノンクレジットエンディング(5.1ch)
■特典ディスク2
　・『ゼーガペインSTA』オルタモーダ編 ビジュアルコメンタリー出演:浅沼晋太郎、花澤香菜、川澄綾子、下田正美監督)
■ブックレット(28P)

【映像特典】
・ティザー予告
・本予告
・上映告知CM

【他、仕様】
・キャラクターデザイン:田頭真理恵描き下ろし三方背ケース

【キャスト】
ソゴル・キョウ:浅沼晋太郎/カミナギ・リョーコ:花澤香菜/ミサキ・シズノ:川澄綾子/マオ・ルーシェン:朴 ろ美(「ろ」は「王」に「路」と書きます)/ルーパ:久野美咲/メイウー:牧野由依/メイイェン:渡辺明乃/クリス:家中 宏/ミナト:井上麻里奈/ハル・ヴェルト:河西健吾/ギテン:寺島拓篤/セフト:寺崎裕香/ミルヒ:黒沢ともよ/バスフォータ:石川由依/シド:花江夏樹/トーヤ:杉田智和/ツクルナ:島袋美由利